La prima attestazione che riporta il nome degli abitanti di Gazzelli  («homines de Gazelio») si trova su un documento del 3 gennaio 1289, data nella quale gli abitanti di Chiusanico e Gazzelli si trovarono a dover prestare nuovamente giuramento alla sede vescovile in seguito alla morte del precedente Vescovo Lanfranco.

 Lungo i secoli sono molte le potenze che hanno avuto il controllo del borgo: dagli Aleramici, dinastia del Sacro Romano Impero, ai Marchesi di Clavesana; dalla Diocesi di Albenga alla potente famiglia genovese dei Doria.

Nell’ottocento il paese di Gazzelli passò alla Repubblica Ligure, in seguito nel Dipartimento di Montenotte sotto l’arrondissement di Porto Maurizio durante l’epoca del Primo Impero Francese, poi confluì nel Regno di Sardegna e infine nel Regno d’Italia.